Ngoài nhiều bài viết trên tờ Nam Phong từ năm 1917 cho đến năm 1932, Nguyễn Bá Trác đã biên soạn thêm nhiều tác phẩm sau:

• Cổ Học viện thư tịch thủ sách (soạn cùng với Nguyễn Tiên Khiêm) gồm 11 quyển (1921)
• Hoàng Việt Giáp Tý niên biểu (1925)
• Bàn về học thuật nước Tàu (1918)
• Hạn mạn du ký (1920. Năm 1921, Đông Kinh ấn quán - Hà Nội in lại)
• Bàn về Hán học (1920)
• Hương Giang mộng (1920)
• Ngã An Nam dân tộc Nam tiến chi lịch sử (1921)
• Mấy lời chung cáo của các nhà Nho (1921)
• Nguyễn Bá Học tiên sinh chi lược sử cập kỳ di ngôn (1921)
• Du Thanh Hòa ký (19210)
• Hán học văn học khảo (1917-1932)...